食管癌的病因尚不明确，可能与下列因素有关：
1.化学因素 亚硝胺类化合物致癌性强，在高发区的膳食、饮水、酸菜、甚至病人的唾液中，测亚硝酸盐含量均远较低发区为高。
2.生物性因素 有些真菌能促使亚硝胺及其前体的形成，更促进癌肿的发生。
3.遗传因素 食管癌具有较显著的家族聚集现象。
4.缺乏某些微量元素 铜、锰、铁、锌等在食物中含量偏低。
5.缺乏维生素 缺乏维生素A、维生素B2、维生素C，以及动物蛋白、新鲜蔬菜、水果摄入不足，是食管癌高发区的一个共同特点。
6.饮食习惯 食物过硬、过热、进食过快，导致食管上皮损伤，增加了对致癌物易感性。
7.其他因素 如食管腐蚀伤、食管慢性炎症、贲门失弛缓症及胃食管长期反流引起的Barrett食管等均有癌变的危险。